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생정보학책의 지은이소개 (Introducing the author)<o:p></o:p>

저자를 소개한다. 저자는 철학자이자 농부다. 어릴 때부터 철학에 관심이 많았다. 어릴 적, 농촌이나 다름없는 곳에서 자라나, 꿈이 남해안의 섬에서 사는 게 꿈이다. 저자는 과학을 배웠기에, 과학과 기술을 통한 철학을 이 우주를 이해하는 방법으로 사용한다. <o:p></o:p>

아래의 문단과 같은 생명현상에 대한 생각을 갖고 있다. 훗날 나의 사상을 "생학"이란 제목의 책으로 출판하겠다.<o:p></o:p>

저자는 모든 우주현상들은 운명으로 결정된 것이 아니라고 생각한다. 그러나운명적일 만큼 정확한 결과를 낳는 원칙들이 우주에 존재한다고 판단한다. 이것은 물리학의 한 가설이기도 하다. 그 원칙들의 정확한 종류와 수는 모른다. 다만, 적은 수일 것이라고 생각한다. 아마, 10개 이하의 큰 수학적 개념으로 우주의 대략적 구조를 설명할 수 있을 것이라고 저자는 추측한다. 그 개념 중에서 중요한 것이  "정보처리 (information processing)"이라고 생각한다. 예를 들어, 물질들의 본질은 정보적 객체 (information object)로 설명이 될 것이라고 본다. 정보의 본질은 상태의 변화다. 정보는 에너지의 변화를 설명하는 데에 쓰인다. 정보는 시간함수로 쉽게 설명된다상태들의 시간적 변화들의 합을 정보로 기록하면 우주의 역사가 된다. <o:p></o:p>

우주의 정보처리를 깊게 관찰할 수 있는 체계는 생명현상이라고 가정한다. 생명현상은 우주의 핵심원칙을 우리에게 보여주는 창문 역할을 한다. 생물학(생명학)에서의 진화의 개념은 정보처리 객체로 이루어진 우주내의 다차원 매트릭스(Matrix) 속에서 평형을 이루는 간단한 물질들의 변화를 추적하는 것이다. 그 추적의 결과는 변화, 선택, 변화, 선택의 진화(Evolution)론으로 설명이 된다. 진화는 위에 말한 우주의 거의 숙명적인 원칙들 중에서 하나일 뿐이다. <o:p></o:p>

생명 현상의 본질은 진화라는 과정보다는  "평형화(Equilibrium)" 라는 이론이 더 적합하다고 생각한다. 이것은 동양사상의 조화 (balance)라는 개념에 가깝다. 생명현상이란 변화를 통해 지속적으로 조화를 이루어 가는 것이며, 이 과정에서 정보처리적인 원칙들을 따른다. 평형과 비 평형을 오가는 이것은 일종의 무한한 스위칭(switching)이다. 생정보학(bioinformatics)는 위의 정보처리적인 우주의 원칙들을 생명현상에서 나오는 기초적 데이터를 가지고 발견해 내는 학문이다. 이 시각에서 나는 기존의 생물학과 정보처리학(Informatics)은 같은 것을 추구하는 것이라고 본다. <o:p></o:p>

거시적으로 볼 때, 생정보학은 생물()학이라는 학문의 현대식 이름이다. 현재의 생물학은 실용적인 내용과 방법론에 있어서 과거의 생물학과는 다르다. 1950-60년대에 분자생물학이 생물학을 대표하는 학문으로 대두되었었고 그 이후 몇 십 년간을 지배한 것과 같은 일이 현재 생정보학을 통해서 일어나고 있다. 미래에는, 생명을 정보학으로 이해할 것이다. <o:p></o:p>

이 책은 이런 위의 철학적 우산아래 실용적 연구/개발 관련 조각 지식들을 싣고 있다. <o:p></o:p>

이 책은 한국어와 영어를 동시에 표기할 수 있는 곳은 그렇게 표기했다. 영어는 과학의 언어이고 생정보학의 언어이며, 생정보학에서 가장 중요한 도구이기에 이 책을 통해 더 가까워지도록 하길 바라는 마음에서 병기했다. 실전에서는 "영어가 생정보학의 가장 핵심 프로그래밍 언어이다". 뛰어난 해커는 영어로 프로그래밍을 한다.

저자의 홈페이지는 http://Jongbhak.com이다.<o:p></o:p>

<st1:date w:st="on" day="9" month="9" year="2005" o:ls="trans">2005 9 9</st1:date>.<o:p></o:p>

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